Situada en pleno centro del casco urbano de Aranda de Duero (Burgos), en su calle más céntrica y popular, la Calle Isilla.

La bodega la componen una serie de galerías subterráneas, a 12 m. de profundidad en el mismo casco antiguo de Aranda de Duero que se excavaron allá por el siglo XIII XIV, aunque el primer indicio de las bodegas de Aranda data en el siglo XV. Reinando el rey Sancho de Navarra se tienen datos de que el vino de la Ribera se vendía en Burgos y en el norte de España y éste se elaboraba en lagares y bodegas.
Aunque su utilidad siempre ha sido la de conservar el vino, en algunas ocasiones se utilizaba también como refugio o vía para salir fuera de la muralla. Aunque no existe mucha documentación se tiene constancia hasta el año 1.900, se elaboraba vino en ésta de forma artesanal y fué en el año de 1.903 cuando la bodega inicia su andadura más industrial para en el 1.929 hacer una reforma importante de medios y tecnología de la época, siendo una de las primeras bodegas en el embotellado en recipiente de vidrio, así como sistemas mecánicos de despalillado y prensado.
Todo esto se realizaba en el lagar, siendo su transporte a bodega por medio de porteadores con pellejos de piel de cabra para subir el vino hasta el punto de venta situada en la parte delantera del lagar, a estos señores se les denominaba subidores de vino.
Este sistema de elaboración se estuvo utilizando hasta los años 1.965 a 1.970, época en la que nacen las cooperativas quedándose obsoleto el sistema tradicional.
Es en el año 1.995 cuando se contempla el ambicioso proyecto de reformar la bodega para volver a hacer lo que durante tantos siglos se estuvo haciendo, un vino artesanal, pero con la tecnología actual, para así poder elaborar unos vinos de calidad y producción limitada amparado bajo un sello como es la D.O. Ribera del Duero. Así nacen Bodegas "El Lagar de Isilla".